2006: Francisco Nájera alsolviert 1 A-Länderspiel für Kolumbien.

18.07.13: Francisco Nájera wird mit Atlético Nacional durch einen 2-0 Erfolg über Santa Fe (Hinspiel: 0-0) kolumbianischer Apertua-Meister 2013.

12.12.13: Francisco Nájera wird mit Atlético Nacional durch einen 2-0 Erfolg über Deportivo Cali (Hinspiel: 0-0) kolumbianischer Clausura-Meister 2013.

21.12.2015: Francisco Nájera wird mit Atletico Nacional Medellin durch einen 3-2 Erfolg im Elfmeterschießen (Hinspiel 1-2/ Rückspiel 1-0) über Atlético Junior Barranquilla kolumbianischer Fußball-Meister 2015.

28.07.2016: Francisco Nájera gewinnt mit Atlético Nacional durch einen 1-0 Erfolg (Hinspiel: 1-1) über Independiente del Valle die Copa Libertadores.

11.05.2017: Francisco Nájera gewinnt mit Atlético Nacional durch einen 4-1 Erfolg (Hinspiel: 1-2) über Associação Chapecoense die Recopa Sudamericana.